线粒体是细胞的“能量工厂”,在能量稳态中发挥重要的作用。线粒体DNA单碱基突变就可导致发育障碍、神经肌肉疾病等多种疾病。开发针对线粒体DNA的基因编辑工具一直是线粒体遗传学领域的长期目标。DdCBE线粒体碱基编辑器可针对双链线粒体DNA,将C·G碱基对编辑为T·A碱基对,实现对线粒体的精准定向编辑。而,一个的潜在安全隐患是线粒体靶向信号的介导能否保证全部 DdCBE 定位在线粒体中,而不是部分泄露到细胞核,从而造成潜在的脱靶编辑。因此对核基因组脱靶效应及工具本身的安全性评估是极为必要的。
2022年5月12日,北京大学伊成器团队在Nature杂志发表了题为“Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations”的研究论文。该研究应用了该团队之前发表的Detect-seq技术,对DdCBE碱基编辑工具在人类细胞中核基因组脱靶编辑进行了无偏向性地评估,并探索了相关机制,发现了TAS依赖型和TAS非依赖型的脱靶;并意外发现由细菌毒素 DddA 构成的 DdCBE 碱基编辑工具与维持细胞三维结构的重要蛋白 CTCF有相互作用。本研究对DdCBE碱基编辑工具在基础研究和疾病治疗中的应用具有重要的意义。
优质的试剂是科学研究的利器。该团队在细胞培养的过程中,使用全式金TransDetect® PCR Mycoplasma Detection Kit对支原体检测,确保细胞无支原体污染;在基因克隆实验中使用TransStart® FastPfu DNA Polymerase进行PCR 片段扩增,并将成功构建的质粒转入Trans1-T1 Phage Resistant化学感受态细胞。
TransDetect® PCR Mycoplasma Detection Kit(FM311)
一款高效的PCR法支原体检测试剂盒,特异性扩增支原体DNA。因操作简便、快速(2小时内即可出结果)、特异性强、灵敏度高的特点备受客户喜爱,多次荣登Nature期刊。
产品特点:
· 灵敏度高,可检测低至20个拷贝的支原体。
· 特异性强,只扩增支原体DNA,真核细胞和细菌DNA不被扩增。
· 操作简便,无需提取基因组DNA,适合大量细胞样品的检测。
· 配有阳性对照与阴性对照,保证PCR检测结果的准确性。
TransStart® FastPfu DNA Polymerase(AP221)
一款快速PCR的热启动高保真DNA聚合酶,克服了普通Pfu酶扩增效率低、产量低和扩增速度慢的缺陷。该产品自上市以来备受客户喜爱,多次荣登Nature、Nature biotechnology、Molecular cell等知名期。
产品特点:
· 保真性是EasyTaq® DNA Polymerase的54倍。
· 扩增产物为平端,可直接克隆于pEASY®-Blunt系列载体中。
· 基因组DNA片段的扩增 (≤ 15 kb)。
· Plasmid DNA片段的扩增 (≤ 20 kb)。
Trans1-T1 Phage Resistant Chemically Competent Cell(CD501)
一款经特殊工艺制作的化学感受态细胞,转化效率高达109cfu/ug DNA以上。自上市以来备受客户喜爱,转化效率高、产品性能稳定,多次荣登Nature、Cell等知名期刊。
产品特点:
· 生长速度快,在氨苄青霉素平板上,8-9小时可见克隆。
· 用于蓝、白斑筛选,12小时可见蓝斑。
· 将过夜培养的单克隆在2 ml的LB培养基中培养4-5小时即可进行小量质粒提取。
· 适用于高效的DNA克隆和质粒扩增,减少克隆DNA同源重组的发生,提高质粒DNA的产量和质量。
· 具有T1, T5噬菌体抗性。
全式金产品再次登上Nature期刊,证明了大家对全式金产品品质和服务的认可,也完美的诠释了全式金“品质高于一切,精品服务客户”的理念。未来,全式金将继续秉持“匠心”与“创新”,打造更多精品,助力科学研究。
使用TransDetect® PCR Mycoplasma Detection Kit(FM311)产品发表的部分文章:
· Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations[J]. Nature, 2022.
· Modulating TRADD to restore cellular homeostasis and inhibit apoptosis[J]. Nature, 2020.
· Rapamycin pretreatment rescues the bone marrow AML cell elimination capacity of CAR-T cells[J]. Clinical Cancer Research, 2021.
使用TransStart® FastPfu DNA Polymeras(AP221)产品发表的部分文章:
· Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations[J]. Nature, 2022.
· An engineered prime editor with enhanced editing efficiency in plants[J]. Nature Biotechnology, 2022.
· Genome-wide specificity of prime editors in plants[J]. Nature Biotechnology, 2021.
· Precise, predictable multi-nucleotide deletions in rice and wheat using APOBEC–Cas9[J]. Nature Biotechnology, 2020.
· Targeted, random mutagenesis of plant genes with dual cytosine and adenine base editors[J]. Nature biotechnology, 2020.
· Prime genome editing in rice and wheat[J]. Nature biotechnology, 2020.
· Rationally designed APOBEC3B cytosine base editors with improved specificity[J]. Molecular cell, 2020.
· The raphe dopamine system controls the expression of incentive memory[J]. Neuron, 2020.
· Taf14 recognizes a common motif in transcriptional machineries and facilitates their clustering by phase separation[J]. Nature communications, 2020.
使用Trans1-T1 Phage Resistant Chemically Competent Cell(CD501)产品发表的部分文章:
· Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations[J]. Nature, 2022.
· Whitefly hijacks a plant detoxification gene that neutralizes plant toxins[J]. Cell, 2021.
· Distinct processing of lncRNAs contributes to non-conserved functions in stem cells[J]. Cell, 2020.
· A defense pathway linking plasma membrane and chloroplasts and co-opted by pathogens[J]. Cell, 2020.
· LDPE microplastics affect soil microbial communities and nitrogen cycling[J]. Science of The Total Environment, 2021.
· Consumption of miRNA-Mediated Insect-Resistant Transgenic Rice Pollen Does Not Harm Apis mellifera Adults[J]. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2021.
· Integrative Proteomic and Phosphoproteomic Analyses of Granulosa Cells During Follicular Atresia in Porcine[J]. Frontiers in cell and developmental biology, 2020.
· Dynamics and Regulations of BimEL Ser65 and Thr112 Phosphorylation in Porcine Granulosa Cells during Follicular Atresia[J]. Cells, 2020.