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喜讯:全式金再获两项国内发明专利授权


 (一)“一种利用qPCR精确定量不同GC含量的二代测序文库的方法及试剂盒”

            2019年08月13日,全式金获此项专利授权,专利号:ZL201610864592.0。


喜讯:全式金再获两项国内发明专利授权


 本发明公开了一种利用qPCR精确定量不同GC含量的二代测序文库的方法及试剂盒。首先提供了利用qPCR精确定量不同GC含量的二代测序文库的试剂盒,包含:多个不同GC含量的标准品,文库稀释液,qPCR预混液,引物,ddH2O。还提供了利用上述试剂盒进行qPCR精确定量不同GC含量的二代测序文库的方法。本发明试剂盒和方法定量精确、使用方便、适用范围广、选择性强、灵敏度高、特异性好、稳定性好,为高质量高效率的测序提供了保证。

 我公司应用此专利技术自主研发的定量试剂盒“TransNGS® Library Quantification Kit for Illumina (KQ101)” 特点:

 · 线性标准品,定量更精确。

 · 选择性强、定量更精确,精心设计多种不同GC 含量的标准品。

 · 特异性强,只扩增双端接头完整的文库分子。

 · 操作简便,直接使用预先稀释好的标准品,包含绝对定量所有必需组分。

 · 扩增效率与灵敏度高,特别优化的qPCR 体系与程序。

 · 适用范围广,可扩增AT/GC 含量高的模板。

 · 兼容性好,兼容所有主流qPCR 仪器。

 · 稳定性好,重复性好。

(1)产品稳定性

 分别使用不同批次产品进行qPCR 检测,结果显示,4 个批次的标准品(S6-S1) 的Ct 值均无明显差异,绘制的标准曲线方程非常稳定,标准品批次间稳定性非常好。


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(2)与主流产品的对比

 分别使用TransGen、K 公司、N 公司及V 公司产品对6 个不同物种的文库进行定量,结果显示,TransGen 与K 公司对6 个文库定量结果无明显差异,而其它两种产品结果明显偏高或偏低,TransGen 产品定量结果与金标准K 公司产品定量结果一致。


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(3)产品极限数据

分别使用TransGen 及K 公司产品对6 个差异明显的文库进行定量,结果显示,TransGen 对不同种属文库、不同GC含量、不同长度、不同浓度的文库都可以精确检测,与金标准K 公司一致,这说明产品适用范围广。文库检测合格后,按照文库定量结果将相同量的不同文库Pooling 至同一条Lane 后进行Illumina HiSeq 测序,数据分析显示,NGS 能获得预期量的clean reads, 并且根据TransGen 与K 公司定量结果所获得的数据量无明显差异。


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 分别使用TransGen 与K 公司文库定量产品对5 种同一浓度的不同GC 含量(25%、37.5%、50%、62.5%、75%)的标准品进行qPCR 检测,结果显示,不同GC 含量的标准品的Ct 值差异小,都可很好地扩增。表明TransGen 产品适用范围广,与金标准K 公司产品相当。


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(4)产品特色与优势

 · 精心设计5 种不同GC 含量的线性标准品,选择性更强,定量更精确。

 分别使用5 种不同GC 含量(25%、37.5%、50%、62.5%、75%)的标准品绘制标准曲线,定量天蓝色链霉菌(左,72%GC)与拟南芥(右,36% GC)这两个DNA 文库的浓度,结果显示,不同GC 含量标准品定量结果差异明显。如果以50% GC Standards 作为标准品,其定量结果明显会相对偏小(p 值都小于0.001,n=4)。因此,天蓝色链霉菌的DNA文库应该选择75% GC Standards 而拟南芥则选择37.5% GC Standards 分别作为其最佳标准品,文库定量结果会更加精确,确保获取更高质量的测序结果。


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 (二)“一种适用于高效反转录反应的反转录引物组合”

            2019年08月13日,全式金获此项专利授权,专利号:ZL201710031139.6。


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 本发明公开了一种适用于高效反转录反应的反转录引物组合,所述反转录引物组合由带有oligo(dT)结构的引物和半随机引物组成,还公开了所述反转录引物在反转录反应中的应用。本发明反转录引物组合在保留了锚定引物优势的同时,避免了普通随机引物所引起的碱基错配和非随机配对,消除传统反转录引物对于mRNA模板5’端、3’端的合成效率偏好性,使mRNA模板各位点能够均匀、无差错地合成到相对应的cDNA中,从而显著提升反转录效率与数据均一性、稳定性。

 除一步法外,Trans RT系列产品均配有Anchored Oligo(dT),结合位点铆钉,特异性高,跨越Poly(A)+结构,保证cDNA合成效率和成功率。

 在此我们要重点介绍一下我司的反转录All-in-One系列产品:

 1)TransScript® All-in-One First-Strand cDNA Synthesis SuperMix for PCR(AT321);

 2)TransScript® II All-in-One First-Strand cDNA Synthesis SuperMix for PCR(AH321);

 这两款产品含有反转录反应所需的全部试剂,只需加入模板RNARNase-free water即可反应。最大程度地简化了操作步骤, 降低了污染几率;反转录反应仅需30min;最佳Anchored Oligo(dT) PrimerRandom Primer(N9)配比,长链cDNA合成效率高;两款产品反转录产物适用于PCR(也可用于qPCR)。

 ·TransScript® All-in-One First-Strand cDNA Synthesis SuperMix for PCR合成长度,TransScript≤12kb;

 ·TransScript® II All-in-One First-Strand cDNA Synthesis SuperMix for PCR合成长度, TransScriptⅡ≤15kb;高热稳定性:反应温度42℃-55℃,最佳反应温度为50℃;适用于高拷贝、低拷贝基因检测;突出高GC含量或具有复杂二级结构的RNA模板。

 3)TransScript® All-in-One First-Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR(One-Step gDNA Removal)(AT341);

 4)TransScript® II All-in-One First-Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR(One-Step gDNA Removal)(AH341)。

 这两款产品含有反转录反应所需的全部试剂,只需加入gDNA Remover,模板RNARNase free water即可反应。最大程度地简化了操作步骤, 降低了污染几率;整个反转录反应仅需15 min;由最佳的Anchored Oligo(dT) PrimerRandom Primer(N9)配比,及优化的SuperMix组成,确保对不同浓度的RNA有相同的反转录效率,短链cDNA合成效率高;该Mix中含有gDNA Remover组分,在同一反应管中,同时完成反转录与基因组DNA的去除,降低污染几率,保证后续qPCR实验结果更加理想。

 两项发明专利的同时授权既是我公司的荣誉,也是对我公司技术水平的肯定,全式金将继续坚持自主研发、创新的发展模式,为广大客户朋友们提供高性价比的产品,助力生命科学的研究和发展。


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